舉辦馬拉松賽事，最棘手的問題莫過於交通問題，主辦單位往往想「聚集人潮」，又要考量「路線通暢」，兩者卻往往相互衝突，無法兼顧；當然相同的問題，也考驗著新竹市政府。

2015新竹城市馬拉松，市政府既然打出要讓跑者「看見全新竹」的口號，路線囊括了市中心、商圈及人氣景點，當然也必須對交通疏導做出因應對策，盡可能避免造成市民不便；市政府以「訊息發佈」和「人力配置」兩主軸雙管齊下，希望藉以提高賽會品質並避免動線堵塞。

主辦單位一來透過廣播車、旗幟、標牌與網路社群等方式多元管道作訊息的宣傳，使市民接收活動訊息，屆時可變通與因應，避免造成市民不便；二來就是增加人力配置，此次賽事共出動超過500名警力與義交，佈署於賽會路線上，加強匝道口管制與疏導。

新竹市警察局局長陳耀南指出，此次活動在市中心配置充分人力，並在重點路段設攔截點，而各路段由交通指揮官指引與疏導，主辦單位預估6-8點在市中心是尖峰時段，在8點過後交通流量即可達到穩定，而在郊區路線則劃分單線道，一方面確保選手的安全，另一方面則也克服造成市民通行不便的問題。

此外，主辦單位日前會同部份選手試跑賽會路線兩次，對於人潮疏導已有應變措施，配合市政府動員龐大的人力，雙雙維繫賽會品質與民眾安全；在路線方面，主辦單位也特地將全馬、半馬這兩個組別與休閒組分開，避免拖慢動線，希望解決馬拉松最大的交通難題。

2015新竹城市馬拉松，主題貫穿古今的風城文化，路線囊括整個的新竹版圖，讓跑者一覽歷史故事與文化資產，當然也確保賽會進行的流暢，才能標榜高品質的「風（瘋）馬」故事。